Q: Позволяет ли TC (сам, или с помощью плагинов) качать с фтп в несколько потоков?
A: Если один файл в несколько потоков - то нет, не позволяет. Это файловый менеджер, а не качалка. Если же хочется закачивать несколько разных файлов одновременно, то просто надо включить опцию "Закачать в фоновом режиме" и вызвать операцию копирования для каждого из файлов по отдельности (или можно объединить по несколько файлов) - тогда каждая из операций запустится в отдельном потоке.